Dark Eve es una historia de ciencia ficción, cargada de acción, en los cuales un joven de nombre Timón Akari se ve envuelto en la necesidad de ayudar a una chica sin memoria llamada Ariel, la cual es perseguida por una poderosa organización conocida como Mesías, la cual parece por alguna razón interesada en la misteriosa chica, que a su vez parece ocultar un pasado tenebroso relacionado con el misterioso proyecto EVE, el cual investigaba el padre de Timón antes de ser brutalmente asesinado por la misma organización Mesías.
